به موجب ماده 13 آیین نامه بند (هـ) تبصره (5) ماده واحده قانون بودجه سال 1397 اینگونه مقرر شده بود که "هزینه‌های ناشی از تنزیل اوراق بهادار اسلامی اعم از اسناد خزانه اسلامی، اوراق مشارکت و سایر اوراق مالی اسلامی که توسط دولت منتشر شده و تضمین صد در صد بازپرداخت آن بر عهده دولت است و در قبال طلب اشخاص از دولت بابت درآمدهای غیرمعاف مالیاتی نظیر فعالیت های پیمانکاری مستقیما به آن ها واگذار شده است، به استناد ماده 147 ق.م.م صرفا برای اشخاص دریافت کننده اوراق مذکور از دولت و حداکثر معادل سود مورد انتظار عقود مشارکتی مصوب شورای پول و اعتبار به عنوان هزینه قابل قبول محسوب می شود."؛ لیکن سازمان امور مالیاتی طی بخشنامه شماره 131/97/200 مورخ 1397/09/18، با این استناد که آیین نامه ابلاغی 15 روز پس از درج در روزنامه رسمی لازم الاجرا می باشد، اعلام نمود که هزینه تنزیل اسناد خزانه اسلامی در حساب مالیاتی صرفاً براساس مقررات مربوطه امکان پذیر است و به عبارت دیگر از تاریخ 1397/08/80 این هزینه به عنوان هزینه قابل قبول مالیاتی مورد پذیرش می باشد؛ در حالیکه آیین نامه‌های اجرایی قوانین بودجه کل کشور مصوب هیأت وزیران کاشف از اراده واقعی قانون‌گذار از ابتدای تصویب قانون می باشد.
در این ارتباط بنابر درخواست‌های مکرر فعالان بخش خصوصی مبنی بر حل مشکل موجود در خصوص تعیین مبداء زمان پذیرش هزینه تنزیل اسناد خزانه اسلامی به عنوان هزینه قابل قبول مالیاتی در قانون بودجه سال 1397؛ این موضوع در دستور کار بررسی توسط کمیته حمایت از کسب و کار قرار گرفت و در هفتاد و پنجمین نشست کمیته مورخ 98/11/28 مقرر شد معاونت حقوقی ریاست جمهوری تاریخ اجرای ماده 13 آیین نامه بند هـ تبصره 5 قانون بودجه سال 1397 (مصوبه شماره 94141/ ت 55455 هـ مورخ 97/07/17) را از ابتدای سال 1397 اعلام نماید.
پیرو این مصوبه سرکار خانم جنیدی، معاون حقوقی ریاست جمهوری و رئیس کمیته حمایت از کسب و کار در چندین نوبت اعلام نظر نمود که زمان اجرای آیین نامه مذکور باید از ابتدای اجرای قانون بودجه یعنی ابتدای سال 1397 باشد، لیکن به لحاظ عدم شفافیت و عدم تعیین مبداء زمانی اجرای آیین نامه در رویه اختلاف ایجاد گردید.
در نهایت با پیگیری‌های دبیرخانه کمیته حمایت از کسب وکار و معاونت حقوقی ریاست جمهوری، موضوع در دستور کار هیأت دولت قرار گرفت و خوشبختانه طی تصویب نامه هیأت وزیران به شماره ۱۴۸۵۷۶/ت ۵۷۹۸۲هـ مورخ 99/12/17، هزینه های تنزیل اوراق بهادار اسلامی اعم از اسناد خزانه اسلامی که در قبال طلب اشخاص از دولت بابت درآمدهای غیرمعاف مالیاتی نظیر فعالیت های پیمانکاری به ایشان واگذار شده است، برای کل سال ۱۳۹۷ به عنوان هزینه قابل قبول مالیاتی مورد پذیرش قرار گرفت.
اصل مصوبه هیأت وزیران از لینک زیر قابل دریافت است.